Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC1P36383 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC1P36383 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC1P36383 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJC1P36383 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJC1P36383 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJC1P36383 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJC1P36383 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJC1P36383 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJC1P36383 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJC1P36383 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJC1P36383 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJC1P36383 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJC1P36383 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC1P36383 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC1P36383 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJC1P36383 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJC1P36383 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJC1P36383 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJC1P36383 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJC1P36383 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJC1P36383 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJC1P36383 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJC1P36383 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJC1P36383 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GJC1P36383 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJC1P36383 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJC1P36383 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJC1P36383 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJC1P36383 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GJC1P36383 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJC1P36383 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJC1P36383 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJC1P36383 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJC1P36383 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC1P36383 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC1P36383 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC1P36383 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC1P36383 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC1P36383 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC1P36383 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJC1P36383 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJC1P36383 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJC1P36383 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJC1P36383 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GJC1P36383 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJC1P36383 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJC1P36383 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJC1P36383 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJC1P36383 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJC1P36383 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJC1P36383 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJC1P36383 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GJC1P36383 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJC1P36383 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJC1P36383 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJC1P36383 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJC1P36383 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJC1P36383 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJC1P36383 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJC1P36383 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJC1P36383 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJC1P36383 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GJC1P36383 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJC1P36383 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJC1P36383 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJC1P36383 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJC1P36383 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJC1P36383 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJC1P36383 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJC1P36383 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJC1P36383 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJC1P36383 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJC1P36383 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJC1P36383 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJC1P36383 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJC1P36383 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJC1P36383 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJC1P36383 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJC1P36383 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJC1P36383 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJC1P36383 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJC1P36383 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJC1P36383 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJC1P36383 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJC1P36383 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJC1P36383 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJC1P36383 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJC1P36383 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJC1P36383 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJC1P36383 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJC1P36383 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJC1P36383 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJC1P36383 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJC1P36383 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJC1P36383 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJC1P36383 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJC1P36383 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJC1P36383 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJC1P36383 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms