Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMI1P35226 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMI1P35226 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMI1P35226 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BMI1P35226 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMI1P35226 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMI1P35226 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMI1P35226 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMI1P35226 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMI1P35226 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMI1P35226 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMI1P35226 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMI1P35226 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMI1P35226 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMI1P35226 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BMI1P35226 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMI1P35226 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMI1P35226 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BMI1P35226 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMI1P35226 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMI1P35226 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMI1P35226 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMI1P35226 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMI1P35226 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMI1P35226 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMI1P35226 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMI1P35226 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMI1P35226 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BMI1P35226 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMI1P35226 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMI1P35226 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMI1P35226 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMI1P35226 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMI1P35226 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMI1P35226 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMI1P35226 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMI1P35226 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMI1P35226 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMI1P35226 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMI1P35226 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMI1P35226 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BMI1P35226 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BMI1P35226 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BMI1P35226 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BMI1P35226 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BMI1P35226 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BMI1P35226 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BMI1P35226 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BMI1P35226 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BMI1P35226 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BMI1P35226 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BMI1P35226 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BMI1P35226 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BMI1P35226 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BMI1P35226 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMI1P35226 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMI1P35226 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMI1P35226 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMI1P35226 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMI1P35226 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMI1P35226 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMI1P35226 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMI1P35226 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMI1P35226 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMI1P35226 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMI1P35226 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMI1P35226 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMI1P35226 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMI1P35226 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMI1P35226 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMI1P35226 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMI1P35226 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMI1P35226 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMI1P35226 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMI1P35226 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMI1P35226 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMI1P35226 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMI1P35226 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMI1P35226 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BMI1P35226 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BMI1P35226 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BMI1P35226 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BMI1P35226 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BMI1P35226 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BMI1P35226 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BMI1P35226 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BMI1P35226 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BMI1P35226 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BMI1P35226 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BMI1P35226 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BMI1P35226 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BMI1P35226 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BMI1P35226 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BMI1P35226 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BMI1P35226 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BMI1P35226 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BMI1P35226 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BMI1P35226 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BMI1P35226 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BMI1P35226 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms