Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXN2P32314 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXN2P32314 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXN2P32314 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXN2P32314 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXN2P32314 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXN2P32314 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOXN2P32314 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXN2P32314 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXN2P32314 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXN2P32314 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXN2P32314 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXN2P32314 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXN2P32314 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXN2P32314 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXN2P32314 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXN2P32314 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXN2P32314 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXN2P32314 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXN2P32314 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXN2P32314 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXN2P32314 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms