Protein–RNA interactions for Protein: P32114

Pax2, Paired box protein Pax-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax2P32114 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax2P32114 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax2P32114 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pax2P32114 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pax2P32114 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax2P32114 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax2P32114 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax2P32114 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax2P32114 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pax2P32114 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax2P32114 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax2P32114 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax2P32114 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax2P32114 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax2P32114 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax2P32114 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax2P32114 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax2P32114 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax2P32114 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax2P32114 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax2P32114 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax2P32114 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax2P32114 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax2P32114 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax2P32114 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax2P32114 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax2P32114 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax2P32114 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax2P32114 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax2P32114 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax2P32114 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax2P32114 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax2P32114 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax2P32114 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms