Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GDI1P31150 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GDI1P31150 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GDI1P31150 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GDI1P31150 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GDI1P31150 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GDI1P31150 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GDI1P31150 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GDI1P31150 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GDI1P31150 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GDI1P31150 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GDI1P31150 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDI1P31150 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDI1P31150 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GDI1P31150 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GDI1P31150 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GDI1P31150 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GDI1P31150 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GDI1P31150 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GDI1P31150 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GDI1P31150 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDI1P31150 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDI1P31150 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDI1P31150 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDI1P31150 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDI1P31150 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDI1P31150 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDI1P31150 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDI1P31150 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDI1P31150 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDI1P31150 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDI1P31150 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDI1P31150 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDI1P31150 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDI1P31150 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDI1P31150 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDI1P31150 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDI1P31150 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GDI1P31150 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GDI1P31150 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GDI1P31150 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GDI1P31150 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GDI1P31150 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GDI1P31150 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDI1P31150 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDI1P31150 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDI1P31150 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDI1P31150 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDI1P31150 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDI1P31150 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDI1P31150 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDI1P31150 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GDI1P31150 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GDI1P31150 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDI1P31150 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GDI1P31150 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDI1P31150 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GDI1P31150 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDI1P31150 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDI1P31150 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GDI1P31150 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GDI1P31150 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GDI1P31150 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GDI1P31150 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GDI1P31150 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GDI1P31150 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GDI1P31150 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GDI1P31150 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDI1P31150 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDI1P31150 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GDI1P31150 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GDI1P31150 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GDI1P31150 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GDI1P31150 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GDI1P31150 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GDI1P31150 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GDI1P31150 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GDI1P31150 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GDI1P31150 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDI1P31150 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDI1P31150 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDI1P31150 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDI1P31150 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDI1P31150 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GDI1P31150 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GDI1P31150 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GDI1P31150 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GDI1P31150 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GDI1P31150 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDI1P31150 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GDI1P31150 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GDI1P31150 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GDI1P31150 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GDI1P31150 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GDI1P31150 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GDI1P31150 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GDI1P31150 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDI1P31150 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDI1P31150 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDI1P31150 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms