Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHRNB4P30926 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB4P30926 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB4P30926 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB4P30926 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB4P30926 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB4P30926 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB4P30926 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB4P30926 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB4P30926 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB4P30926 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB4P30926 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB4P30926 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB4P30926 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms