Protein–RNA interactions for Protein: P30793

GCH1, GTP cyclohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCH1P30793 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCH1P30793 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCH1P30793 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCH1P30793 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCH1P30793 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCH1P30793 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCH1P30793 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCH1P30793 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCH1P30793 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCH1P30793 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCH1P30793 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCH1P30793 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCH1P30793 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCH1P30793 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCH1P30793 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCH1P30793 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCH1P30793 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCH1P30793 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCH1P30793 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCH1P30793 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCH1P30793 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCH1P30793 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCH1P30793 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCH1P30793 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCH1P30793 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCH1P30793 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCH1P30793 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCH1P30793 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCH1P30793 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCH1P30793 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCH1P30793 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCH1P30793 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCH1P30793 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCH1P30793 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCH1P30793 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCH1P30793 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCH1P30793 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCH1P30793 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCH1P30793 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCH1P30793 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GCH1P30793 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCH1P30793 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCH1P30793 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCH1P30793 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCH1P30793 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCH1P30793 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCH1P30793 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCH1P30793 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCH1P30793 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCH1P30793 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCH1P30793 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCH1P30793 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCH1P30793 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCH1P30793 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCH1P30793 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCH1P30793 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCH1P30793 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCH1P30793 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCH1P30793 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCH1P30793 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCH1P30793 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCH1P30793 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCH1P30793 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCH1P30793 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCH1P30793 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCH1P30793 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCH1P30793 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCH1P30793 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCH1P30793 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCH1P30793 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCH1P30793 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCH1P30793 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCH1P30793 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCH1P30793 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCH1P30793 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCH1P30793 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCH1P30793 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCH1P30793 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCH1P30793 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCH1P30793 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCH1P30793 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCH1P30793 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCH1P30793 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCH1P30793 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCH1P30793 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCH1P30793 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCH1P30793 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCH1P30793 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCH1P30793 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCH1P30793 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCH1P30793 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCH1P30793 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCH1P30793 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCH1P30793 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCH1P30793 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCH1P30793 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCH1P30793 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCH1P30793 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCH1P30793 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCH1P30793 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms