Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tacr2P30549 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tacr2P30549 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tacr2P30549 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tacr2P30549 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tacr2P30549 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tacr2P30549 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tacr2P30549 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tacr2P30549 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tacr2P30549 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tacr2P30549 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tacr2P30549 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tacr2P30549 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tacr2P30549 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tacr2P30549 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tacr2P30549 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tacr2P30549 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tacr2P30549 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tacr2P30549 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tacr2P30549 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tacr2P30549 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tacr2P30549 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tacr2P30549 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tacr2P30549 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tacr2P30549 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tacr2P30549 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tacr2P30549 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms