Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VtnP29788 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VtnP29788 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VtnP29788 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VtnP29788 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VtnP29788 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VtnP29788 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VtnP29788 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VtnP29788 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VtnP29788 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VtnP29788 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VtnP29788 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VtnP29788 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VtnP29788 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VtnP29788 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VtnP29788 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VtnP29788 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VtnP29788 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VtnP29788 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VtnP29788 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VtnP29788 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VtnP29788 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VtnP29788 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VtnP29788 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VtnP29788 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VtnP29788 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VtnP29788 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VtnP29788 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VtnP29788 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VtnP29788 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VtnP29788 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VtnP29788 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VtnP29788 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VtnP29788 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VtnP29788 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VtnP29788 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VtnP29788 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VtnP29788 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VtnP29788 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VtnP29788 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VtnP29788 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VtnP29788 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VtnP29788 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VtnP29788 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VtnP29788 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VtnP29788 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VtnP29788 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VtnP29788 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VtnP29788 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VtnP29788 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VtnP29788 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VtnP29788 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VtnP29788 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VtnP29788 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VtnP29788 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VtnP29788 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VtnP29788 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VtnP29788 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VtnP29788 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VtnP29788 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VtnP29788 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VtnP29788 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VtnP29788 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VtnP29788 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VtnP29788 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VtnP29788 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VtnP29788 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VtnP29788 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VtnP29788 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VtnP29788 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VtnP29788 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VtnP29788 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VtnP29788 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VtnP29788 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VtnP29788 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VtnP29788 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VtnP29788 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VtnP29788 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VtnP29788 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VtnP29788 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VtnP29788 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VtnP29788 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VtnP29788 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VtnP29788 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VtnP29788 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VtnP29788 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VtnP29788 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VtnP29788 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VtnP29788 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VtnP29788 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VtnP29788 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VtnP29788 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VtnP29788 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VtnP29788 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VtnP29788 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VtnP29788 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VtnP29788 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VtnP29788 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VtnP29788 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VtnP29788 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms