Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD34P28906 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD34P28906 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD34P28906 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD34P28906 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD34P28906 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD34P28906 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD34P28906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD34P28906 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD34P28906 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD34P28906 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD34P28906 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD34P28906 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD34P28906 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD34P28906 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD34P28906 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD34P28906 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD34P28906 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD34P28906 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD34P28906 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD34P28906 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD34P28906 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD34P28906 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD34P28906 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD34P28906 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD34P28906 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD34P28906 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD34P28906 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD34P28906 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD34P28906 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD34P28906 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD34P28906 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD34P28906 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD34P28906 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD34P28906 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD34P28906 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD34P28906 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD34P28906 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD34P28906 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD34P28906 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD34P28906 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD34P28906 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD34P28906 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD34P28906 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD34P28906 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD34P28906 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD34P28906 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD34P28906 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD34P28906 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD34P28906 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD34P28906 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD34P28906 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD34P28906 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD34P28906 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD34P28906 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD34P28906 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD34P28906 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD34P28906 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD34P28906 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD34P28906 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD34P28906 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD34P28906 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD34P28906 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD34P28906 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD34P28906 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD34P28906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD34P28906 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD34P28906 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD34P28906 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD34P28906 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD34P28906 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD34P28906 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD34P28906 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD34P28906 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD34P28906 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD34P28906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD34P28906 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD34P28906 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD34P28906 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD34P28906 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD34P28906 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD34P28906 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD34P28906 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD34P28906 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD34P28906 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD34P28906 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD34P28906 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD34P28906 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD34P28906 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD34P28906 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD34P28906 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD34P28906 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD34P28906 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD34P28906 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD34P28906 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD34P28906 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD34P28906 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD34P28906 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD34P28906 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD34P28906 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms