Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GABRB3P28472 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB3P28472 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRB3P28472 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRB3P28472 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB3P28472 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB3P28472 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB3P28472 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB3P28472 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB3P28472 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GABRB3P28472 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB3P28472 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GABRB3P28472 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABRB3P28472 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRB3P28472 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB3P28472 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB3P28472 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB3P28472 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB3P28472 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRB3P28472 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRB3P28472 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRB3P28472 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRB3P28472 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRB3P28472 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRB3P28472 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRB3P28472 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABRB3P28472 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB3P28472 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB3P28472 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB3P28472 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRB3P28472 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRB3P28472 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GABRB3P28472 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB3P28472 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.5 ms