Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HOXD10P28358 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXD10P28358 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXD10P28358 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HOXD10P28358 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
HOXD10P28358 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HOXD10P28358 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXD10P28358 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
HOXD10P28358 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HOXD10P28358 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
HOXD10P28358 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HOXD10P28358 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HOXD10P28358 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXD10P28358 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXD10P28358 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXD10P28358 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HOXD10P28358 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HOXD10P28358 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HOXD10P28358 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HOXD10P28358 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HOXD10P28358 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HOXD10P28358 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HOXD10P28358 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXD10P28358 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXD10P28358 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXD10P28358 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXD10P28358 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HOXD10P28358 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HOXD10P28358 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HOXD10P28358 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HOXD10P28358 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXD10P28358 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXD10P28358 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXD10P28358 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXD10P28358 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HOXD10P28358 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HOXD10P28358 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HOXD10P28358 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HOXD10P28358 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HOXD10P28358 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXD10P28358 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD10P28358 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXD10P28358 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HOXD10P28358 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HOXD10P28358 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXD10P28358 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
HOXD10P28358 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXD10P28358 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HOXD10P28358 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXD10P28358 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXD10P28358 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXD10P28358 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms