Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR2CP28335 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR2CP28335 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR2CP28335 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR2CP28335 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR2CP28335 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR2CP28335 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2CP28335 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR2CP28335 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR2CP28335 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTR2CP28335 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR2CP28335 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR2CP28335 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR2CP28335 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR2CP28335 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR2CP28335 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR2CP28335 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR2CP28335 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR2CP28335 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2CP28335 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms