Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa4P28311 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa4P28311 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa4P28311 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa4P28311 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa4P28311 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa4P28311 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa4P28311 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa4P28311 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa4P28311 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa4P28311 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa4P28311 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa4P28311 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa4P28311 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa4P28311 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa4P28311 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa4P28311 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms