Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DMAP28067 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DMAP28067 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DMAP28067 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DMAP28067 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DMAP28067 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DMAP28067 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DMAP28067 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DMAP28067 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DMAP28067 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DMAP28067 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DMAP28067 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DMAP28067 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DMAP28067 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-DMAP28067 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DMAP28067 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DMAP28067 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms