Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIFP27352 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIFP27352 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIFP27352 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GIFP27352 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GIFP27352 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIFP27352 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIFP27352 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIFP27352 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIFP27352 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIFP27352 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIFP27352 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIFP27352 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIFP27352 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIFP27352 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIFP27352 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIFP27352 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIFP27352 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIFP27352 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIFP27352 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIFP27352 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIFP27352 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIFP27352 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIFP27352 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIFP27352 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIFP27352 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIFP27352 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIFP27352 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIFP27352 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIFP27352 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIFP27352 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIFP27352 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIFP27352 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIFP27352 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIFP27352 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIFP27352 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIFP27352 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIFP27352 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIFP27352 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIFP27352 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIFP27352 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIFP27352 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIFP27352 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIFP27352 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIFP27352 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIFP27352 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIFP27352 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIFP27352 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIFP27352 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIFP27352 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIFP27352 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIFP27352 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIFP27352 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIFP27352 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIFP27352 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIFP27352 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIFP27352 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIFP27352 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIFP27352 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIFP27352 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIFP27352 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIFP27352 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GIFP27352 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIFP27352 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIFP27352 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIFP27352 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIFP27352 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIFP27352 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIFP27352 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIFP27352 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIFP27352 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIFP27352 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIFP27352 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GIFP27352 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIFP27352 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIFP27352 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GIFP27352 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIFP27352 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIFP27352 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIFP27352 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIFP27352 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIFP27352 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIFP27352 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIFP27352 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GIFP27352 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GIFP27352 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIFP27352 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIFP27352 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIFP27352 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIFP27352 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIFP27352 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIFP27352 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIFP27352 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIFP27352 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIFP27352 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIFP27352 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIFP27352 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIFP27352 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIFP27352 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIFP27352 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms