Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3RAP26951 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3RAP26951 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL3RAP26951 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL3RAP26951 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL3RAP26951 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL3RAP26951 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL3RAP26951 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL3RAP26951 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL3RAP26951 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IL3RAP26951 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL3RAP26951 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms