Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL8A2P25067 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL8A2P25067 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL8A2P25067 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL8A2P25067 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL8A2P25067 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL8A2P25067 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL8A2P25067 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL8A2P25067 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL8A2P25067 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL8A2P25067 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL8A2P25067 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL8A2P25067 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL8A2P25067 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL8A2P25067 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms