Protein–RNA interactions for Protein: P25025

CXCR2, C-X-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR2P25025 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCR2P25025 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CXCR2P25025 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR2P25025 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR2P25025 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCR2P25025 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCR2P25025 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCR2P25025 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCR2P25025 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR2P25025 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCR2P25025 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCR2P25025 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCR2P25025 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCR2P25025 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518.1 ms