Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR1P25024 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCR1P25024 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR1P25024 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR1P25024 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR1P25024 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR1P25024 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR1P25024 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR1P25024 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR1P25024 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR1P25024 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR1P25024 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR1P25024 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR1P25024 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms