Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDELR1P24390 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDELR1P24390 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDELR1P24390 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDELR1P24390 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDELR1P24390 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDELR1P24390 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDELR1P24390 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDELR1P24390 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDELR1P24390 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDELR1P24390 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDELR1P24390 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDELR1P24390 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDELR1P24390 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDELR1P24390 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDELR1P24390 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDELR1P24390 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDELR1P24390 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDELR1P24390 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDELR1P24390 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDELR1P24390 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDELR1P24390 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms