Protein–RNA interactions for Protein: P24158

PRTN3, Myeloblastin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3P24158 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRTN3P24158 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTN3P24158 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTN3P24158 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRTN3P24158 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRTN3P24158 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRTN3P24158 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRTN3P24158 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRTN3P24158 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRTN3P24158 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms