Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRR1P24046 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRR1P24046 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR1P24046 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRR1P24046 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR1P24046 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRR1P24046 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR1P24046 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR1P24046 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms