Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hoxd11P23813 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hoxd11P23813 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Hoxd11P23813 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hoxd11P23813 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hoxd11P23813 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hoxd11P23813 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxd11P23813 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxd11P23813 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hoxd11P23813 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hoxd11P23813 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hoxd11P23813 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hoxd11P23813 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hoxd11P23813 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hoxd11P23813 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hoxd11P23813 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hoxd11P23813 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxd11P23813 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxd11P23813 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Hoxd11P23813 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxd11P23813 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxd11P23813 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxd11P23813 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxd11P23813 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxd11P23813 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxd11P23813 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxd11P23813 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hoxd11P23813 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxd11P23813 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxd11P23813 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxd11P23813 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxd11P23813 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxd11P23813 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxd11P23813 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hoxd11P23813 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxd11P23813 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxd11P23813 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxd11P23813 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxd11P23813 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxd11P23813 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxd11P23813 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hoxd11P23813 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxd11P23813 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxd11P23813 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Hoxd11P23813 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Hoxd11P23813 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Hoxd11P23813 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hoxd11P23813 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hoxd11P23813 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Hoxd11P23813 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxd11P23813 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxd11P23813 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxd11P23813 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxd11P23813 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Hoxd11P23813 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Hoxd11P23813 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hoxd11P23813 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hoxd11P23813 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hoxd11P23813 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxd11P23813 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxd11P23813 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxd11P23813 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxd11P23813 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxd11P23813 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxd11P23813 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxd11P23813 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hoxd11P23813 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hoxd11P23813 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Hoxd11P23813 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxd11P23813 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxd11P23813 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxd11P23813 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Hoxd11P23813 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxd11P23813 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms