Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLDCP23378 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLDCP23378 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLDCP23378 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GLDCP23378 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLDCP23378 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLDCP23378 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLDCP23378 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLDCP23378 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLDCP23378 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLDCP23378 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLDCP23378 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLDCP23378 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLDCP23378 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLDCP23378 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLDCP23378 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLDCP23378 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLDCP23378 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLDCP23378 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLDCP23378 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GLDCP23378 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLDCP23378 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLDCP23378 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLDCP23378 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLDCP23378 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLDCP23378 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLDCP23378 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLDCP23378 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLDCP23378 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLDCP23378 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLDCP23378 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLDCP23378 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLDCP23378 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLDCP23378 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLDCP23378 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLDCP23378 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLDCP23378 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLDCP23378 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLDCP23378 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLDCP23378 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GLDCP23378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLDCP23378 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLDCP23378 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GLDCP23378 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLDCP23378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLDCP23378 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLDCP23378 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GLDCP23378 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLDCP23378 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLDCP23378 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GLDCP23378 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLDCP23378 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLDCP23378 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLDCP23378 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLDCP23378 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLDCP23378 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLDCP23378 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLDCP23378 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLDCP23378 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLDCP23378 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLDCP23378 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLDCP23378 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLDCP23378 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLDCP23378 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLDCP23378 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLDCP23378 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLDCP23378 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLDCP23378 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLDCP23378 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLDCP23378 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLDCP23378 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLDCP23378 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLDCP23378 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLDCP23378 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLDCP23378 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLDCP23378 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLDCP23378 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLDCP23378 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLDCP23378 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLDCP23378 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLDCP23378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLDCP23378 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLDCP23378 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLDCP23378 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLDCP23378 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLDCP23378 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLDCP23378 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLDCP23378 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLDCP23378 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GLDCP23378 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLDCP23378 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GLDCP23378 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLDCP23378 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GLDCP23378 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLDCP23378 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLDCP23378 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GLDCP23378 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GLDCP23378 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLDCP23378 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLDCP23378 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms