Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggta1P23336 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggta1P23336 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ggta1P23336 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggta1P23336 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggta1P23336 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggta1P23336 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggta1P23336 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggta1P23336 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggta1P23336 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggta1P23336 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ggta1P23336 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ggta1P23336 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggta1P23336 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggta1P23336 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggta1P23336 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ggta1P23336 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ggta1P23336 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ggta1P23336 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggta1P23336 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggta1P23336 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggta1P23336 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggta1P23336 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggta1P23336 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggta1P23336 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggta1P23336 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggta1P23336 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggta1P23336 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ggta1P23336 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ggta1P23336 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ggta1P23336 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggta1P23336 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms