Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmbsP22907 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmbsP22907 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HmbsP22907 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HmbsP22907 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HmbsP22907 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HmbsP22907 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HmbsP22907 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HmbsP22907 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HmbsP22907 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HmbsP22907 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HmbsP22907 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HmbsP22907 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HmbsP22907 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HmbsP22907 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HmbsP22907 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HmbsP22907 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HmbsP22907 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HmbsP22907 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HmbsP22907 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HmbsP22907 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HmbsP22907 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HmbsP22907 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HmbsP22907 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HmbsP22907 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HmbsP22907 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HmbsP22907 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmbsP22907 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HmbsP22907 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmbsP22907 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HmbsP22907 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmbsP22907 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmbsP22907 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmbsP22907 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmbsP22907 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmbsP22907 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HmbsP22907 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HmbsP22907 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HmbsP22907 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmbsP22907 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HmbsP22907 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HmbsP22907 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmbsP22907 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HmbsP22907 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmbsP22907 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmbsP22907 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HmbsP22907 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmbsP22907 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmbsP22907 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmbsP22907 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HmbsP22907 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmbsP22907 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmbsP22907 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmbsP22907 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmbsP22907 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmbsP22907 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmbsP22907 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmbsP22907 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HmbsP22907 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms