Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CA4P22748 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CA4P22748 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CA4P22748 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CA4P22748 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CA4P22748 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CA4P22748 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CA4P22748 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CA4P22748 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CA4P22748 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CA4P22748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CA4P22748 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CA4P22748 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CA4P22748 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CA4P22748 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CA4P22748 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CA4P22748 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CA4P22748 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CA4P22748 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CA4P22748 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CA4P22748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CA4P22748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CA4P22748 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CA4P22748 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CA4P22748 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CA4P22748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CA4P22748 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CA4P22748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CA4P22748 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CA4P22748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CA4P22748 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CA4P22748 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CA4P22748 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CA4P22748 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CA4P22748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CA4P22748 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CA4P22748 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CA4P22748 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CA4P22748 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CA4P22748 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CA4P22748 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CA4P22748 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CA4P22748 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CA4P22748 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CA4P22748 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CA4P22748 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CA4P22748 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA4P22748 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA4P22748 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA4P22748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA4P22748 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CA4P22748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CA4P22748 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CA4P22748 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CA4P22748 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CA4P22748 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA4P22748 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA4P22748 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA4P22748 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA4P22748 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CA4P22748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CA4P22748 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CA4P22748 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CA4P22748 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA4P22748 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA4P22748 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA4P22748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA4P22748 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CA4P22748 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CA4P22748 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CA4P22748 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CA4P22748 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CA4P22748 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CA4P22748 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CA4P22748 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CA4P22748 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA4P22748 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA4P22748 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA4P22748 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CA4P22748 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CA4P22748 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CA4P22748 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CA4P22748 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA4P22748 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA4P22748 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA4P22748 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA4P22748 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA4P22748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA4P22748 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA4P22748 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CA4P22748 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CA4P22748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CA4P22748 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CA4P22748 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CA4P22748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CA4P22748 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CA4P22748 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CA4P22748 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CA4P22748 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CA4P22748 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms