Protein–RNA interactions for Protein: P21661

Pcsk2, Neuroendocrine convertase 2, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk2P21661 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk2P21661 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcsk2P21661 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcsk2P21661 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcsk2P21661 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcsk2P21661 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcsk2P21661 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk2P21661 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcsk2P21661 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk2P21661 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk2P21661 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk2P21661 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk2P21661 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk2P21661 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk2P21661 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcsk2P21661 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcsk2P21661 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk2P21661 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk2P21661 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk2P21661 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk2P21661 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk2P21661 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcsk2P21661 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk2P21661 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk2P21661 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk2P21661 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk2P21661 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk2P21661 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk2P21661 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk2P21661 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcsk2P21661 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk2P21661 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk2P21661 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcsk2P21661 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk2P21661 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcsk2P21661 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk2P21661 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcsk2P21661 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk2P21661 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk2P21661 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcsk2P21661 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcsk2P21661 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcsk2P21661 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk2P21661 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk2P21661 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk2P21661 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk2P21661 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk2P21661 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk2P21661 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk2P21661 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk2P21661 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms