Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PdgfaP20033 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PdgfaP20033 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdgfaP20033 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdgfaP20033 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PdgfaP20033 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PdgfaP20033 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdgfaP20033 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PdgfaP20033 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfaP20033 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdgfaP20033 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdgfaP20033 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfaP20033 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfaP20033 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfaP20033 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfaP20033 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PdgfaP20033 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfaP20033 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfaP20033 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfaP20033 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfaP20033 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfaP20033 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PdgfaP20033 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfaP20033 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfaP20033 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfaP20033 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PdgfaP20033 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfaP20033 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfaP20033 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfaP20033 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfaP20033 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfaP20033 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdgfaP20033 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfaP20033 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfaP20033 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PdgfaP20033 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdgfaP20033 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfaP20033 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms