Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NelfeP19426 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NelfeP19426 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NelfeP19426 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NelfeP19426 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NelfeP19426 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NelfeP19426 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NelfeP19426 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NelfeP19426 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NelfeP19426 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NelfeP19426 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NelfeP19426 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NelfeP19426 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NelfeP19426 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NelfeP19426 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NelfeP19426 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NelfeP19426 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NelfeP19426 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NelfeP19426 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NelfeP19426 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NelfeP19426 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NelfeP19426 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NelfeP19426 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NelfeP19426 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NelfeP19426 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NelfeP19426 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NelfeP19426 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NelfeP19426 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NelfeP19426 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NelfeP19426 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NelfeP19426 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NelfeP19426 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NelfeP19426 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NelfeP19426 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NelfeP19426 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NelfeP19426 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NelfeP19426 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NelfeP19426 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NelfeP19426 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NelfeP19426 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NelfeP19426 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NelfeP19426 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NelfeP19426 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NelfeP19426 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NelfeP19426 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NelfeP19426 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NelfeP19426 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NelfeP19426 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NelfeP19426 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NelfeP19426 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NelfeP19426 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NelfeP19426 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NelfeP19426 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NelfeP19426 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NelfeP19426 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NelfeP19426 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NelfeP19426 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NelfeP19426 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NelfeP19426 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NelfeP19426 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NelfeP19426 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NelfeP19426 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NelfeP19426 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NelfeP19426 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NelfeP19426 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NelfeP19426 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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