Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT15P19012 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT15P19012 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT15P19012 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT15P19012 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT15P19012 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT15P19012 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT15P19012 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT15P19012 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT15P19012 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT15P19012 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT15P19012 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT15P19012 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT15P19012 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT15P19012 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT15P19012 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT15P19012 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT15P19012 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT15P19012 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT15P19012 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT15P19012 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT15P19012 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT15P19012 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT15P19012 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT15P19012 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT15P19012 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT15P19012 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT15P19012 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT15P19012 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT15P19012 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT15P19012 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT15P19012 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KRT15P19012 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT15P19012 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT15P19012 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT15P19012 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT15P19012 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT15P19012 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT15P19012 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT15P19012 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT15P19012 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT15P19012 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT15P19012 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT15P19012 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT15P19012 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT15P19012 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT15P19012 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT15P19012 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT15P19012 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT15P19012 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT15P19012 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT15P19012 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT15P19012 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT15P19012 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT15P19012 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT15P19012 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT15P19012 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT15P19012 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT15P19012 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT15P19012 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT15P19012 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT15P19012 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT15P19012 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT15P19012 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT15P19012 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT15P19012 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT15P19012 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT15P19012 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT15P19012 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT15P19012 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT15P19012 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT15P19012 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT15P19012 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT15P19012 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT15P19012 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT15P19012 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT15P19012 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT15P19012 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT15P19012 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT15P19012 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT15P19012 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT15P19012 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT15P19012 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT15P19012 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT15P19012 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT15P19012 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT15P19012 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT15P19012 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT15P19012 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT15P19012 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT15P19012 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT15P19012 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT15P19012 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT15P19012 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT15P19012 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT15P19012 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT15P19012 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT15P19012 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT15P19012 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT15P19012 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms