Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKMT2P17540 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CKMT2P17540 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKMT2P17540 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CKMT2P17540 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CKMT2P17540 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CKMT2P17540 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CKMT2P17540 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKMT2P17540 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKMT2P17540 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CKMT2P17540 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CKMT2P17540 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKMT2P17540 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CKMT2P17540 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKMT2P17540 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKMT2P17540 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKMT2P17540 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKMT2P17540 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMT2P17540 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CKMT2P17540 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKMT2P17540 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms