Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTRB1P17538 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTRB1P17538 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTRB1P17538 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTRB1P17538 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTRB1P17538 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTRB1P17538 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTRB1P17538 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTRB1P17538 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTRB1P17538 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTRB1P17538 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTRB1P17538 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRB1P17538 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms