Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prph2P15499 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prph2P15499 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prph2P15499 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prph2P15499 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prph2P15499 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prph2P15499 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prph2P15499 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prph2P15499 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prph2P15499 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prph2P15499 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prph2P15499 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prph2P15499 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prph2P15499 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prph2P15499 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prph2P15499 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prph2P15499 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prph2P15499 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prph2P15499 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prph2P15499 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prph2P15499 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prph2P15499 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prph2P15499 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prph2P15499 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prph2P15499 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prph2P15499 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prph2P15499 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prph2P15499 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms