Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2F2P13984 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2F2P13984 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2F2P13984 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2F2P13984 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2F2P13984 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2F2P13984 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2F2P13984 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2F2P13984 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2F2P13984 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2F2P13984 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2F2P13984 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2F2P13984 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2F2P13984 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2F2P13984 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms