Protein–RNA interactions for Protein: P13707

Gpd1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpd1P13707 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpd1P13707 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpd1P13707 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpd1P13707 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpd1P13707 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpd1P13707 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpd1P13707 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpd1P13707 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpd1P13707 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpd1P13707 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpd1P13707 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpd1P13707 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpd1P13707 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpd1P13707 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpd1P13707 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpd1P13707 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpd1P13707 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpd1P13707 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpd1P13707 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpd1P13707 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpd1P13707 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpd1P13707 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpd1P13707 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms