Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEACAM1P13688 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEACAM1P13688 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEACAM1P13688 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEACAM1P13688 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEACAM1P13688 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CEACAM1P13688 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEACAM1P13688 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CEACAM1P13688 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEACAM1P13688 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEACAM1P13688 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CEACAM1P13688 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEACAM1P13688 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CEACAM1P13688 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEACAM1P13688 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEACAM1P13688 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEACAM1P13688 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEACAM1P13688 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CEACAM1P13688 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEACAM1P13688 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEACAM1P13688 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEACAM1P13688 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEACAM1P13688 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEACAM1P13688 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEACAM1P13688 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEACAM1P13688 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEACAM1P13688 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEACAM1P13688 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEACAM1P13688 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEACAM1P13688 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEACAM1P13688 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEACAM1P13688 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEACAM1P13688 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEACAM1P13688 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms