Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MS4A1P11836 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MS4A1P11836 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MS4A1P11836 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MS4A1P11836 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MS4A1P11836 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MS4A1P11836 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MS4A1P11836 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MS4A1P11836 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MS4A1P11836 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MS4A1P11836 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MS4A1P11836 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MS4A1P11836 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
MS4A1P11836 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MS4A1P11836 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MS4A1P11836 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MS4A1P11836 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MS4A1P11836 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MS4A1P11836 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MS4A1P11836 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MS4A1P11836 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MS4A1P11836 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MS4A1P11836 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MS4A1P11836 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MS4A1P11836 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MS4A1P11836 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MS4A1P11836 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MS4A1P11836 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MS4A1P11836 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MS4A1P11836 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MS4A1P11836 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MS4A1P11836 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MS4A1P11836 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
MS4A1P11836 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MS4A1P11836 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MS4A1P11836 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MS4A1P11836 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MS4A1P11836 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MS4A1P11836 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MS4A1P11836 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms