Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DmdP11531 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DmdP11531 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DmdP11531 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DmdP11531 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DmdP11531 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DmdP11531 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DmdP11531 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DmdP11531 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DmdP11531 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DmdP11531 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DmdP11531 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DmdP11531 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DmdP11531 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DmdP11531 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DmdP11531 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DmdP11531 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DmdP11531 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DmdP11531 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DmdP11531 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DmdP11531 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DmdP11531 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DmdP11531 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DmdP11531 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DmdP11531 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DmdP11531 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DmdP11531 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DmdP11531 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DmdP11531 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DmdP11531 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DmdP11531 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DmdP11531 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DmdP11531 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DmdP11531 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DmdP11531 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DmdP11531 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DmdP11531 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DmdP11531 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DmdP11531 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DmdP11531 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DmdP11531 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DmdP11531 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DmdP11531 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DmdP11531 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DmdP11531 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DmdP11531 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DmdP11531 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DmdP11531 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DmdP11531 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DmdP11531 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DmdP11531 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DmdP11531 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DmdP11531 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DmdP11531 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DmdP11531 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DmdP11531 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DmdP11531 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DmdP11531 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DmdP11531 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DmdP11531 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DmdP11531 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DmdP11531 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DmdP11531 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DmdP11531 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DmdP11531 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DmdP11531 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DmdP11531 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DmdP11531 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DmdP11531 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DmdP11531 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DmdP11531 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DmdP11531 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DmdP11531 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DmdP11531 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DmdP11531 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DmdP11531 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DmdP11531 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DmdP11531 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DmdP11531 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DmdP11531 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DmdP11531 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DmdP11531 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DmdP11531 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DmdP11531 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DmdP11531 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
DmdP11531 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DmdP11531 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DmdP11531 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DmdP11531 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DmdP11531 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DmdP11531 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DmdP11531 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DmdP11531 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DmdP11531 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DmdP11531 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DmdP11531 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DmdP11531 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DmdP11531 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DmdP11531 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DmdP11531 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms