Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APELAP0DMC3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APELAP0DMC3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APELAP0DMC3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APELAP0DMC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APELAP0DMC3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APELAP0DMC3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APELAP0DMC3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APELAP0DMC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APELAP0DMC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms