Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM13P0DJ93 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM13P0DJ93 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM13P0DJ93 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM13P0DJ93 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM13P0DJ93 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM13P0DJ93 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM13P0DJ93 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM13P0DJ93 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM13P0DJ93 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM13P0DJ93 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM13P0DJ93 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM13P0DJ93 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms