Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC159P0C7I6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC159P0C7I6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC159P0C7I6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC159P0C7I6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC159P0C7I6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC159P0C7I6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC159P0C7I6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC159P0C7I6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC159P0C7I6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC159P0C7I6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC159P0C7I6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC159P0C7I6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC159P0C7I6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC159P0C7I6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms