Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTAP09496 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTAP09496 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTAP09496 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTAP09496 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTAP09496 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTAP09496 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTAP09496 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTAP09496 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTAP09496 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CLTAP09496 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTAP09496 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLTAP09496 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CLTAP09496 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLTAP09496 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLTAP09496 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTAP09496 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTAP09496 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTAP09496 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTAP09496 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTAP09496 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTAP09496 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTAP09496 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTAP09496 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTAP09496 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTAP09496 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLTAP09496 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTAP09496 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTAP09496 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTAP09496 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTAP09496 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLTAP09496 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTAP09496 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTAP09496 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTAP09496 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTAP09496 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTAP09496 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTAP09496 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTAP09496 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTAP09496 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTAP09496 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTAP09496 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLTAP09496 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTAP09496 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTAP09496 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CLTAP09496 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTAP09496 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTAP09496 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTAP09496 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTAP09496 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTAP09496 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTAP09496 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTAP09496 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTAP09496 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTAP09496 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTAP09496 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTAP09496 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTAP09496 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTAP09496 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTAP09496 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTAP09496 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTAP09496 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTAP09496 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTAP09496 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTAP09496 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTAP09496 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTAP09496 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTAP09496 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTAP09496 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTAP09496 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTAP09496 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTAP09496 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTAP09496 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTAP09496 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTAP09496 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTAP09496 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTAP09496 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTAP09496 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTAP09496 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTAP09496 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTAP09496 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTAP09496 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTAP09496 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTAP09496 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLTAP09496 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLTAP09496 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTAP09496 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTAP09496 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTAP09496 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTAP09496 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTAP09496 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTAP09496 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTAP09496 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTAP09496 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTAP09496 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTAP09496 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTAP09496 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTAP09496 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTAP09496 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTAP09496 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms