Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD48P09326 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD48P09326 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD48P09326 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CD48P09326 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD48P09326 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD48P09326 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD48P09326 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD48P09326 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD48P09326 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD48P09326 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD48P09326 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD48P09326 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD48P09326 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD48P09326 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD48P09326 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD48P09326 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD48P09326 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD48P09326 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD48P09326 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD48P09326 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD48P09326 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD48P09326 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD48P09326 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD48P09326 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD48P09326 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD48P09326 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD48P09326 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD48P09326 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD48P09326 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD48P09326 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD48P09326 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD48P09326 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD48P09326 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD48P09326 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD48P09326 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD48P09326 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD48P09326 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD48P09326 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD48P09326 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD48P09326 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD48P09326 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD48P09326 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD48P09326 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD48P09326 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD48P09326 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CD48P09326 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD48P09326 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD48P09326 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD48P09326 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD48P09326 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD48P09326 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD48P09326 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD48P09326 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD48P09326 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD48P09326 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD48P09326 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD48P09326 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD48P09326 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD48P09326 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD48P09326 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD48P09326 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD48P09326 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD48P09326 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD48P09326 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD48P09326 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CD48P09326 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD48P09326 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD48P09326 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD48P09326 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD48P09326 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD48P09326 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD48P09326 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD48P09326 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD48P09326 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD48P09326 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD48P09326 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD48P09326 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD48P09326 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD48P09326 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD48P09326 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD48P09326 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD48P09326 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD48P09326 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD48P09326 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD48P09326 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD48P09326 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD48P09326 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD48P09326 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD48P09326 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD48P09326 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD48P09326 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD48P09326 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms