Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HBQ1P09105 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HBQ1P09105 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HBQ1P09105 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HBQ1P09105 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HBQ1P09105 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HBQ1P09105 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HBQ1P09105 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HBQ1P09105 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HBQ1P09105 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HBQ1P09105 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms