Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB5P09067 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB5P09067 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB5P09067 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB5P09067 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB5P09067 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB5P09067 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB5P09067 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB5P09067 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB5P09067 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB5P09067 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB5P09067 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms