Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD55P08174 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD55P08174 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD55P08174 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD55P08174 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD55P08174 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD55P08174 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD55P08174 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD55P08174 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD55P08174 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD55P08174 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD55P08174 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD55P08174 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD55P08174 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD55P08174 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD55P08174 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD55P08174 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD55P08174 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD55P08174 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD55P08174 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD55P08174 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD55P08174 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD55P08174 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD55P08174 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD55P08174 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD55P08174 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD55P08174 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD55P08174 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD55P08174 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD55P08174 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD55P08174 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD55P08174 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD55P08174 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD55P08174 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD55P08174 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD55P08174 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD55P08174 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD55P08174 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD55P08174 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD55P08174 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD55P08174 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD55P08174 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD55P08174 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD55P08174 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD55P08174 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD55P08174 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD55P08174 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD55P08174 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD55P08174 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD55P08174 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD55P08174 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD55P08174 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD55P08174 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD55P08174 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD55P08174 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD55P08174 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD55P08174 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD55P08174 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD55P08174 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD55P08174 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD55P08174 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD55P08174 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD55P08174 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD55P08174 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD55P08174 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD55P08174 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD55P08174 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD55P08174 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD55P08174 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD55P08174 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD55P08174 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD55P08174 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD55P08174 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD55P08174 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD55P08174 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD55P08174 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD55P08174 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD55P08174 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD55P08174 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD55P08174 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD55P08174 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD55P08174 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD55P08174 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD55P08174 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD55P08174 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD55P08174 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD55P08174 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD55P08174 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD55P08174 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD55P08174 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD55P08174 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD55P08174 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD55P08174 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD55P08174 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD55P08174 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD55P08174 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD55P08174 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD55P08174 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD55P08174 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD55P08174 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms