Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRM2P08172 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRM2P08172 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRM2P08172 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRM2P08172 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM2P08172 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM2P08172 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM2P08172 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRM2P08172 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms