Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI1P08151 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI1P08151 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI1P08151 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI1P08151 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI1P08151 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI1P08151 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI1P08151 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI1P08151 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI1P08151 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI1P08151 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI1P08151 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI1P08151 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI1P08151 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI1P08151 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI1P08151 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI1P08151 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI1P08151 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI1P08151 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI1P08151 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI1P08151 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI1P08151 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI1P08151 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI1P08151 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI1P08151 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI1P08151 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI1P08151 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI1P08151 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI1P08151 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI1P08151 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI1P08151 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI1P08151 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI1P08151 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI1P08151 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI1P08151 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI1P08151 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI1P08151 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI1P08151 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI1P08151 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI1P08151 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI1P08151 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI1P08151 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLI1P08151 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLI1P08151 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI1P08151 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GLI1P08151 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI1P08151 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI1P08151 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI1P08151 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI1P08151 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI1P08151 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI1P08151 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI1P08151 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI1P08151 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI1P08151 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI1P08151 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI1P08151 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI1P08151 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI1P08151 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI1P08151 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI1P08151 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI1P08151 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI1P08151 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI1P08151 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI1P08151 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI1P08151 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI1P08151 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI1P08151 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI1P08151 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI1P08151 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI1P08151 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI1P08151 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI1P08151 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI1P08151 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI1P08151 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI1P08151 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI1P08151 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI1P08151 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI1P08151 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI1P08151 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI1P08151 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI1P08151 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI1P08151 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI1P08151 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI1P08151 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI1P08151 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI1P08151 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI1P08151 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI1P08151 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI1P08151 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI1P08151 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI1P08151 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI1P08151 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI1P08151 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI1P08151 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI1P08151 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI1P08151 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI1P08151 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI1P08151 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI1P08151 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms